Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Pramef12Q9D2F1 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Pramef12Q9D2F1 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Pramef12Q9D2F1 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Pramef12Q9D2F1 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Pramef12Q9D2F1 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Pramef12Q9D2F1 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Pramef12Q9D2F1 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Pramef12Q9D2F1 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Pramef12Q9D2F1 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Pramef12Q9D2F1 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Pramef12Q9D2F1 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms