Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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