Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Igsf9b-204ENSMUST00000214357 16144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Zfp292-202ENSMUST00000098163 9941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Nalcn-201ENSMUST00000000201 7122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
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PtprtQ99M80 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
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PtprtQ99M80 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Med13l-202ENSMUST00000201010 7781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
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PtprtQ99M80 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Ptprj-201ENSMUST00000111493 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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PtprtQ99M80 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
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PtprtQ99M80 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
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PtprtQ99M80 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
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PtprtQ99M80 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
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PtprtQ99M80 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
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PtprtQ99M80 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
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PtprtQ99M80 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
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PtprtQ99M80 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
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