Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms