Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Nup88Q8CEC0 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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