Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Zzz3-203ENSMUST00000106101 7539 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Akr1c19-202ENSMUST00000118663 5832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 F5-201ENSMUST00000086040 7430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Unc79-208ENSMUST00000179002 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Dclk1-201ENSMUST00000054237 7847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms