Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms