Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccbe1Q3MI99 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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