Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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