Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms