Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SbdsP70122 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SbdsP70122 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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