Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rps27aP62983 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms