Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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VdrP48281 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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VdrP48281 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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