Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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