Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms