Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P20040 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
P20040 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
P20040 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
P20040 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
P20040 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
P20040 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
P20040 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
P20040 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
P20040 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
P20040 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
P20040 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
P20040 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
P20040 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
P20040 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
P20040 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
P20040 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
P20040 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
P20040 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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