Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
P10404 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms