Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn5O54942 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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Cldn5O54942 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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Cldn5O54942 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn5O54942 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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