Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Rnf4Q9QZS2 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Rnf4Q9QZS2 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Rnf4Q9QZS2 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Rnf4Q9QZS2 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Rnf4Q9QZS2 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Rnf4Q9QZS2 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Rnf4Q9QZS2 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Rnf4Q9QZS2 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Rnf4Q9QZS2 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnf4Q9QZS2 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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