Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms