Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

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Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rb1cc1Q9ESK9 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Rb1cc1Q9ESK9 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rb1cc1Q9ESK9 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rb1cc1Q9ESK9 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rb1cc1Q9ESK9 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rb1cc1Q9ESK9 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rb1cc1Q9ESK9 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Apbb2-204ENSMUST00000159786 6333 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rb1cc1Q9ESK9 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms