Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms