Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms