Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc71Q8VEG0 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc71Q8VEG0 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc71Q8VEG0 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc71Q8VEG0 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccdc71Q8VEG0 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccdc71Q8VEG0 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccdc71Q8VEG0 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccdc71Q8VEG0 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccdc71Q8VEG0 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccdc71Q8VEG0 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccdc71Q8VEG0 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms