Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CipcQ8R0W1 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CipcQ8R0W1 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CipcQ8R0W1 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CipcQ8R0W1 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CipcQ8R0W1 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CipcQ8R0W1 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CipcQ8R0W1 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CipcQ8R0W1 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CipcQ8R0W1 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CipcQ8R0W1 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CipcQ8R0W1 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CipcQ8R0W1 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CipcQ8R0W1 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CipcQ8R0W1 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CipcQ8R0W1 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CipcQ8R0W1 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CipcQ8R0W1 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CipcQ8R0W1 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CipcQ8R0W1 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CipcQ8R0W1 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CipcQ8R0W1 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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