Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Spen-201ENSMUST00000078886 12082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Trps1-206ENSMUST00000184458 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NischQ80TM9 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms