Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms