Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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