Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms