Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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VdrP48281 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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VdrP48281 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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VdrP48281 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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VdrP48281 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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VdrP48281 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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VdrP48281 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
VdrP48281 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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VdrP48281 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VdrP48281 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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