Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Churc1-201ENSMUST00000041262 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AC154506.2-201ENSMUST00000225481 1276 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm25608-201ENSMUST00000104021 132 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms