Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms