Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms