Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms