Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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