Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg3Q9CPX6 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms