Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4Q8VCH8 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms