Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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Atg4aQ8C9S8 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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Atg4aQ8C9S8 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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Atg4aQ8C9S8 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.32
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Atg4aQ8C9S8 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Atg4aQ8C9S8 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Atg4aQ8C9S8 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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