Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Ccdc88cQ6VGS5 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Ccdc88cQ6VGS5 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Ccdc88cQ6VGS5 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Ccdc88cQ6VGS5 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Ccdc88cQ6VGS5 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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