Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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Sft2d1Q5SSN7 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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