Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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Q3U6N9 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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Q3U6N9 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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