Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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