Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 CT009515.1-201ENSMUST00000228127 586 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Vbp1P61759 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms