Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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VdrP48281 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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VdrP48281 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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VdrP48281 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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VdrP48281 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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VdrP48281 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VdrP48281 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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