Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P20040 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.8 ms