Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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PdgfaP20033 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PdgfaP20033 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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