Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RhoP15409 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RhoP15409 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RhoP15409 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RhoP15409 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RhoP15409 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RhoP15409 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RhoP15409 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RhoP15409 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RhoP15409 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RhoP15409 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RhoP15409 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RhoP15409 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RhoP15409 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RhoP15409 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RhoP15409 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RhoP15409 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RhoP15409 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RhoP15409 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RhoP15409 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RhoP15409 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RhoP15409 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RhoP15409 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RhoP15409 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RhoP15409 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RhoP15409 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RhoP15409 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RhoP15409 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms