Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P10404 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P10404 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
P10404 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P10404 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P10404 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P10404 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
P10404 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
P10404 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P10404 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
P10404 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P10404 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
P10404 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P10404 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P10404 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P10404 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P10404 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P10404 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms