Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp35M0QWN7 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms