Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Cul1-203ENSMUST00000143941 530 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm16494-201ENSMUST00000165525 261 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Rnf141-210ENSMUST00000177462 859 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm32710-201ENSMUST00000210677 618 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm8948-201ENSMUST00000216371 370 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Olfr960-203ENSMUST00000216584 1148 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 AC167202.2-201ENSMUST00000220155 296 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 AC207128.2-202ENSMUST00000224010 808 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Olfr285-201ENSMUST00000079736 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 6330409D20Rik-201ENSMUST00000009695 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm21541-201ENSMUST00000098128 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Bcl2a1d-201ENSMUST00000098486 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Cops2-203ENSMUST00000110463 3392 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm28444-201ENSMUST00000190777 2137 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 C87977-202ENSMUST00000105754 1407 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm28038F7BCN9 Sycn-201ENSMUST00000119180 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms